ERA Chair iSTARS

 

Informatics and Statistical Tools for the Advancement of Research Success

 

O projeto ERA Chair iSTARS é um projeto da Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa, com a duração de seis anos, financiado pela União Europeia (Projeto 952377), que tem como principal objetivo a promoção da ciência de dados como uma ferramenta de investigação em saúde e medicina, através da criação e consolidação de uma unidade de ciência dados de excelência reconhecida internacionalmente, liderada pelo/a investigador/a ERA Chair.

 

Em destaque

homem de óculos sorri

João Carlos Guimarães, recém-chegado investigador à FMUL, foi o escolhido para liderar uma equipa de investigação ao abrigo do projeto ERA Chair iSTARS! O propósito é de aliar a inteligência artificial e a medicina para criar bases de dados com capacidade para armazenar uma grande quantidade e variedade de informação, assim como desenvolver modelos de aprendizagem automática (machine learning) para identificar padrões nesses dados. A partir daqui está criada a possibilidade para novas investigações que procuram respostas no âmbito do combate e da prevenção de doenças, mas também na criação de novos medicamentos. Ler mais»

 

 

O projeto ERA Chair iSTARS – Informatics and Statistical Tools for the Advancement of Research Success constitui-se estrategicamente como a chave para desbloquear, capacitar e otimizar o potencial da investigação médica, através do círculo virtuoso: melhor ciência de dados, maior utilização de dados, boas questões de investigação, publicações de elevado impacto, maior capacidade de obter financiamento competitivo – conduzindo a mais e melhores recursos e gerando mais valor para a investigação médica levada a cabo na FMUL.

O projeto ERA Chair iSTARS vai estabelecer uma nova unidade de ciência de dados consolidando a visão da FMUL através do desenvolvimento de competências sólidas em:

  • Ciência de dados, incluindo bioestatística, gestão de dados e processamento de dados.
  • Big data, incluindo processamento e análise de registos clínicos informatizados, registos de imagem e novas plataformas de investigação.
  • Inteligência artificial na medicina, aqui definida, como processamento natural da linguagem e aprendizagem automática (machine learning).

 

Infografia dos objetivos do projeto iSTARS

Objetivos

O recrutamento do/a investigador/a ERA Chair será fundamental para a organização e desenvolvimento de uma estratégia efetiva para a formação e desenvolvimento de competências na construção de uma ciência de dados de qualidade para a investigação médica.

Aumentar o número de candidaturas a concursos internacionais liderados pela FMUL através:

  • da promoção da colaboração entre departamentos,
  • do fomento da qualidade metodológica e capacidade analítica,
  • da otimização acesso e utilização de dados preliminares,
  • do desenvolvimento do potencial de investigação dos investigadores biomédicos e clínicos.

Contribuir para um aumento do número de publicações científicas em revistas científicas de elevado impacto, através da exploração de recursos de dados já disponíveis.

Implementar, na FMUL, uma unidade de estatística, ciência de dados e informática altamente dinâmica e sustentável. Esta unidade irá promover a maior e melhor utilização da ciência de dados pelos stakeholders incluindo os investigadores, farmacêuticas, sociedades científicas, associações de doentes, organismos locais e nacionais, procurando melhorar a tradução da investigação em soluções aplicadas (translação).

O projeto iSTARS irá fortalecer as competências necessárias (por exemplo através da formação) para a participação em grandes projetos internacionais, nomeadamente em investigação aplicada ou ensaios clínicos; ou ainda a integração em consórcios de infraestruturas europeias, como por exemplo, o ECRIN-ERIC.

Estimular e colaborar na implementação das prioridades do Espaço Europeu de Investigação (EEI), nomeadamente através da adoção oficial da Carta Europeia do Investigador e do Código de Conduta para o Recrutamento de Investigadores, procurando obter a certificação da EURAXESS “Human Resources Excellence in Research (HR4SR)” para a FMUL.

Impacto

Promoção de mudanças institucionais estimulando a participação plena da FMUL no Espaço Europeu (EEI) de Investigação através do alinhamento com as 6 prioridades EEI.

Avaliação de impacto: Aumentar o número de publicações científicas da FMUL em acesso aberto. Obter o reconhecimento “Human Resources Excellence in Research Award (HR4SR)” da EURAXESS.

O projeto iSTARS irá possibilitar a contratação de um investigador de topo e da sua equipa de investigação. Desta forma, irá contribuir para a investigação de excelência na FMUL e, ainda, para aumentar a sua atratividade internacional.

Avaliação de impacto: Recrutamento do/a investigador/a Era Chair e da sua equipa. Alcançar o reconhecimento “Human Resources Excellence in Research Award (HR4SR)” da EURAXESS.

O/A investigador/a Era Chair terá flexibilidade de criar uma estrutura de trabalho que permita facilitar melhores ferramentas informáticas e estatísticas ao serviço da comunidade científica da FMUL, consolidando uma investigação de excelência.

O projeto promoverá ainda o envolvimento da indústria através da criação de um grupo de stakeholders interessados em desenvolver parcerias.

Avaliação de impacto: Aumentar o número de publicações/ano em revistas científicas de referência. Formação de um grupo ativo de stakeholders interessados em desenvolver investigação conjunta.

Liderado pelo/a investigador/a ERA Chair, o projeto iSTARS irá desenvolver competências em gestão de projetos, procura de financiamento e apoio na submissão de candidaturas, otimizando a capacidade de competir por financiamento internacional da comunidade científica da FMUL.

Avaliação de impacto: Aumentar o número de candidaturas com a coordenação da FMUL em concursos internacionais. 

O projeto iSTARS irá contribuir para a formação na área de ciência de dados, mas também na área da Ciência Aberta e mainstreaming de género.

O iSTARS ajudará ainda a consolidar a posição da FMUL no Translational and Clinical Research Infrastructure Specialisation Platform – Health Cluster Portugal (TRIS-HCP)

O projeto contribuirá ainda para a indústria criativa e cultural através da colaboração com três artistas – na produção de 2 obras de arte e na organização de um workshop em visualização de dados.

Avaliação de impacto: Desenvolver recursos para que a FMUL seja um parceiro ativo na TRIS-HCP.

Desenvolver um plano para que a FMUL se torne um centro de dados certificado pelo ECRIN. Desenvolvimento de um plano de ação estratégico para a participação em outros consórcios e infraestruturas de investigação.

 

O projeto iSTARS encontra-se dividido em oito pacotes de trabalho (work packages, WP), numa lógica integrada, que abrange todas as fases do projeto, desde a sua fase inicial, até à criação das condições que permitam a sua continuidade de forma sustentada. 

 

Infografia do Planeamento do Projeto iSTARS

 

Este pacote de trabalho assegurará uma gestão de projetos eficiente, para que se alcancem os objetivos globais do projeto no tempo estipulado, nomeadamente as entregas previstas (deliverables) e as metas (milestones).

Este pacote de trabalho promoverá, em estreita colaboração com o gabinete de comunicação da FMUL, boas práticas em comunicação de ciência e na disseminação de resultados de investigação. Também incluirá a gestão da comunicação com os stakeholders, comunidade científica, indústria, entidades de governação e com a sociedade em geral, adequando e diversificando conteúdos, estilos e canais de comunicação, promovendo uma a comunicação efetiva.

Este pacote de trabalho centra-se precisamente no recrutamento de um/a excelente investigador/a para ocupar o lugar de ERA Chair, assegurando o seu envolvimento em atividades que promovam a investigação de excelência, impactando a positivamente a investigação e inovação na FMUL.

O WP 4 pretende implementar a visão e as prioridades da ERA, alinhando a FMUL com esses princípios. Este WP incluirá diversas ações como a implementação da Carta Europeia dos Investigadores e o Código de Conduta para o Recrutamento de Investigadores; a inclusão da dimensão de género na investigação clínica ou a promoção de metodologias de investigação que utilizem dados abertos (open data research).

As atividades previstas neste WP procuram desenvolver recursos e competências de excelência em informática médica e ciência de dados, na FMUL, que permitam a otimização do desenho de pesquisa e a análise de dados. Deste modo, será possível desenvolver uma investigação de alto impacto, aumentando a probabilidade de captação de financiamento externo. O desenvolvimento de competências incluirá ainda ações de formação avançada com a colaboração de investigadores internacionais e representantes da indústria, ou a participação em eventos científicos internacionais.

Este WP é dedicado à delineação de uma estratégia de potenciação das competências dos investigadores e dos grupos de investigação, promovendo a sua colaboração e a candidatura conjunta a oportunidades de financiamento internacional. Assente no mapeamento e análise sistemática das necessidades de formação e das competências existentes de entre os investigadores e grupos de investigação, o WP 6 procurará criar oportunidades de formação e de apoio à investigação que respondam às necessidades identificadas, procurando fomentar a qualidade, relevância e inovação dos projetos de investigação.

As atividades neste WP procuram desenvolver um plano a longo prazo para a sustentabilidade do projeto. O/A ERA Chair será responsável por avaliar a possibilidade e potencialidade de se constituir um serviço de consultoria em ciência de dados na FMUL e/ou a criação de um centro de dados certificado pela ECRIN-ERIC.

Este WP assegurará que a investigação conduzida pela equipa iSTARS tem em conta as recomendações mais recentes em matéria de ética, estando em conformidade com as melhores práticas internacionais e alinhada com os princípios éticos da União Europeia.

A Comissão Europeia definiu 6 prioridades a implementar no Espaço Europeu de Investigação (EEI): maior efetividade dos sistemas nacionais de investigação; ótima cooperação transnacional e competição & infraestruturas de investigação; mercado de trabalho aberto para investigadores, igualdade de género e mainstreaming de género na investigação; circulação, acesso e transferência de conhecimento científico e cooperação internacional.

Embora algumas destas prioridades estejam fora do âmbito de ação da FMUL como “Sistemas nacionais de investigação mais efetivos” e “Ótima cooperação e competição transnacional”, o projeto iSTARS irá trabalhar no sentido de se alinhar com estas estratégias para a investigação.

 

Infografia das Prioridades do Projeto iSTARS

O projeto iSTARS irá promover a publicação científica em acesso aberto. Irá também trabalhar com os investigadores da FMUL no sentido de se disponibilizarem também as bases de dados, de forma “o mais aberto possível, com as restrições necessárias”, em linha com a estratégia da European Open Science Cloud (EOSC). A ciência aberta e os dados abertos são uma prioridade chave no projeto iSTARS.

O projeto iSTARS é orientado pela Carta Europeia de Investigadores e pelo Código de Conduta na Contratação de Investigadores: começando por um processo de recrutamento internacional do/a investigador/a ERA Chair EEI transparente e assente no mérito. O projeto irá fomentar as condições necessárias para o desenvolvimento da investigação incluindo: uma equipa de apoio à investigação, equipamento e a possibilidade de determinar as linhas de investigação a seguir. Paralelamente, a equipa do projeto iSTARS irá desenhar um programa de ação estratégico para que a FMUL seja reconhecida pela EURAXESS com o “Human Resources Excellence in Research Award (HR4SR)

A FMUL está completamente comprometida na implementação da igualdade de género em todas as áreas da sua ação: gestão, educação, investigação. O projeto iSTARS irá promover a igualdade de género na ciência e tecnologia, no sentido também de alcançar o reconhecimento “Human Resources Excellence in Research Award (HR4SR)”. É ainda uma da prioridade deste projeto a valorização de uma perspetiva de género na própria investigação: trazendo para a investigação médica a incorporação desta dimensão desde a preparação, desenho de pesquisa, implementação e avaliação. Esta dimensão adquire ainda maior relevância no campo da medicina, onde o género pode tomar um lugar relevante nos próprios resultados de investigação.

O projeto iSTARS irá apoiar a cooperação internacional na área da informática médica, quer através da sua rede de parceiros atuais, quer através de novas parcerias. Assim, alinhado com este objetivo, o projeto irá implementar um processo de recrutamento internacional do/a investigador/a ERA Chair.

O projeto iSTARS irá utilizar e contribuir para o Roteiro Nacional de Infrastruturas de Investigação. É expectável uma associação à TRIS-HCP (Translational and Clinical research Infrastructure Specialisation Platform – Health Cluster Portugal), uma plataforma que procura aproximar a investigação laboratorial da prática médica e clínica. A FMUL integra a TRIS-HCP e o projeto iSTARS pretende tirar partido desta rede para consolidar a posição da FMUL para que os seus investigadores possam participar ativamente nos projetos promovidos pela Infraestrutura Europeia para a Medicina Translacional (EATRIS).

 

ícone investigação Istars

 

Missão

A nossa equipa desenvolve soluções baseadas em ciência de dados capazes de gerar novo conhecimento e recomendações para impulsionar a investigação biomédica e os serviços de saúde.

 

Investigação

A ciência de dados é um campo multidisciplinar que integra os múltiplos passos do fluxo de dados, desde a sua coleção até à produção de conhecimento. O grande volume e diversidade de dados de saúde gerados diariamente, provenientes de registos clínicos de doentes, dados de smartwatches ou perfis genéticos, podem ser combinados com a versatilidade dos modelos de inteligência artificial para aprender padrões complexos a partir de diferentes modalidades de dados potenciando o desenvolvimento de novas soluções computacionais nas áreas de investigação e prática clínica.

 A nossa visão é que a ciência de dados vai ser essencial para uma mudança de paradigma nos cuidados de saúde atualmente focados no tratamento de doenças, para cuidados de saúde centrados na prevenção e na promoção da saúde. A nossa equipa procura desenvolver plataformas baseadas em ciência de dados capazes de recolher informação, visualizá-la e gerar novo conhecimento. Pretendemos contribuir para um sistema de saúde mais personalizado, centrado na pessoa (saudável ou doente), mais eficiente e com uma melhor relação custo-benefício.

ícone translação Istars

 

Disponível brevemente

 

Coordenação 

homem de bata branca sorri

Fausto J. Pinto

Coordenador do projeto iSTARS. Professor Catedrático de Cardiologia na FMUL. Foi diretor da FMUL entre 2015 e 2022. Atualmente, coordena o Centro Cardiovascular da Universidade de Lisboa (CCUL). É também diretor do Serviço de Cardiologia do Hospital de Santa Maria e o do departamento de Coração e Vasos do Centro Hospitalar Lisboa Norte. Durante a sua carreira, dedicada à Cardiologia, ao ensino e à investigação, foi agraciado com inúmeros prémios e distinções nacionais e internacionais, pela comunidade científica e médica.

 

mulher de farda hospitalar sorri

Ana Abreu

Co-coordenadora do projeto iSTARS. Professora Auxiliar de Cardiologia na FMUL. É atualmente diretora do Instituto de Medicina Preventiva e Saúde Pública, do Instituto de Saúde Ambiental (ISAMB) e do Laboratório de Exercício e Reabilitação Cardiovascular. Na FMUL coordena ainda o Mestrado de Reabilitação Cardiovascular e o Programa de Reabilitação Cardiovascular da FMUL/CHULN acreditado pela European Society of Cardiology, em 2020. Trabalhou como Assistente Hospitalar Graduada de Cardiologia no Serviço de Cardiologia do Hospital de Santa Marta, entre 1987 e 2017 e do Hospital de Santa Maria a partir de 2018.

 

Brigida Riso

 

Brígida Riso

Gestora de projeto iSTARS. Professora Auxiliar Convidada. É doutorada em Sociologia e Mestre em Saúde, Medicina e Sociedade pelo Iscte-IUL. Os seus interesses de investigação são os biobancos, dados em saúde, a participação cidadã em investigação em saúde e a integridade na investigação. É formadora certificada em Integridade na Investigação (VIRT2UE) e em Ciência Aberta (OpenAire).

 

Conselho Consultivo

Luisa loura

 

Luísa Loura

Professora Associada da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa e investigadora do Centro de Estatística e Aplicações – CEAUL - da mesma universidade. É doutorada em Estatística e Computação. Foi Diretora Geral de Estatísticas do Ministério da Educação. Atualmente é diretora da PORDATA – uma base de dados que recolhe e disponibiliza dados estatísticos, de forma aberta, sobre Portugal contemporâneo.

 

Ana Godinho

Ana Godinho

Doutorada em Neurobiologia, tem-se vindo a dedicar à comunicação de ciência, tendo mais de 18 anos de experiência em Portugal, Reino Unido e Suíça. Neste campo, desenvolveu estratégias de comunicação de ciência para instituições como Instituto Gulbenkian Ciência (Portugal), Universidade de Edimburgo (Escócia), Fundação para a Ciência e Tecnologia (Portugal) e atualmente para o CERN (Suíça), onde é diretora do departamento de Educação, Comunicação e Divulgação do CERN.

 

mulher de cabelo castanho

Marie Davidian

Professora de Estatística na Universidade de Carolina do Norte (J. Stuart Hunter Distinguished Professor), nos Estados Unidos da América. Desenvolveu o seu trabalho na área dos métodos estatísticos para estimar os regimes de tratamento de dados ótimos, métodos para análise de ensaios clínicos e estudos observacionais incluindo o desenho de inferências causais, modelos estatísticos e métodos para a análise de dados longitudinais; métodos para gerir dados em falta (missing) e mismeasured data, e ainda análise farmacodinâmica e farmacocinética. Foi presidente da Associação Americana de estatística, em 2013. Foi condecorada com diversos prémios na área da Estatística: o Prémio Janet L. Norwood (2007) que distingue mulheres pelo contributo na área da estatística, o Prémio George W. Snedecor (2009) e o Prémio Florence Nightingale David (2011).

 

homem de óculos

Rodolphe Thiebaut

Diretor do Bordeaux Population Health (França). É responsável pelo programa em estatística para “Biologia de sistemas e Medicina Translacional” e responsável pelo apoio metodológico à investigação clínica no Centre Hospitalier Universitaire de Bordéus, França. Os seus principais interesses de investigação são o desenvolvimento de estatísticas e análise de medidas de repetição de dados, big data em medicina translacional e modelação matemática das doenças infeciosas. É também diretor do programa de Saúde Pública Digital.

 

Equipa de investigação

homem de óculos

 

João C. Guimarães

Investigador Principal iSTARS. Professor Catedrático Convidado na Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa. É doutorado em Inteligência Artificial e licenciado em Engenharia de Sistemas e Informática pela Universidade do Minho, Portugal. Tem vindo a empregar métodos computacionais multidisciplinares na área da investigação biomédica e saúde, combinando ciência de dados, aprendizagem automática, biologia computacional, genómica e biologia de sistemas.

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Investigadores

Brevemente, o/a investigador/a EEI será responsável por recrutar a sua equipa de investigação que o/a ajudará na concretização dos objetivos do iSTARS.

 

 

Descrição Disseminação Pública Mês
WP1 Gestão de Projeto    
D1.1 Introduzir as publicações prévias na “Continuous Reporting Tool” Sim M2
D1.2 Primeira versão do plano de gestão de dados Não M6
D1.3 Manual de procedimentos normalizados de gestão   Não M18
WP2 Comunicação e Disseminação de Resultados    
D2.1 Lançamento do website do projeto Sim M8
D2.2 Estratégia de branding e plano de comunicação   Não M18
D2.3 Organização de simpósio sobre visualização de dados Sim M45
D2.4 Obra de arte (I) Sim M21
D2.5 Obra de arte (II) Sim M45
WP3 Recrutar o/a investigador/a ERA Chair    
D3.1 Reportar o processo de recrutamento do/a Investigador/a ERA Chair Não M9
WP4 Implementação da visão e prioridades do Espaço Europeu de Investigação (EEI)    
D4.1 Evento internacional sobre mainstreaming de género na investigação médica  Sim M27
D4.2 Primeiro plano de ação para implementação do HRS4R Não M30
D4.3 Avaliação interina Não M54
D4.4 Documentar a estratégia da FMUL para alcançar as prioridades do EEI Não M45
D4.5 Definir políticas de “open data” Não M45
WP5 Desenvolvimento de Recursos e Capacidades    
D5.1 Desenvolver um plano de formação profissional para o pessoal de apoio do projeto Não M18
D5.2 Evento internacional de divulgação de resultados (I) Sim M32
D5.3 Evento internacional de divulgação de resultados (II) Sim M56
WP6 Identificação de competências, recursos e potencial dos grupos de investigação     
D6.1 Plano estratégico para a participação em infraestruturas europeias Não M60
WP7 Definir a necessidade de um serviço de dados e desenvolver um plano de sustentabilidade    
D7.1 Plano de sustentabilidade para o impacto do iSTARS na FMUL Não M72
WP8 Requisitos Éticos    
D8.1 H – Requisito N.º 2 Não M8
D8.2 H – Requisito N.º 3 Não M8
D8.3 POPD - Requisito N.º 6 Não M8
D8.4 POPD - Requisito N.º 7 Não M8
D8.5 POPD - Requisito N.º 8  Não M8
D8.6 POPD - Requisito N.º 9 Não M8
D8.7 POPD – Requisito N.º 10 Não M8
D8.8 GEN - Requisito N.º 14 Não M8
D8.9 GEN - Requisito N.º 15 Não M6

 

 

  • Canto E Castro, L., Pereira, A., Ribeiro, R., Alves, C., Veloso, L., Vicente, V., Alves, D., Domingues, I., Silva, C., Gomes, A., Serrano, M., Afonso, Â., Veldhoen, M., de Sousa, M., de Sousa, J., de Sousa, G., Mota, M. M., Silva-Santos, B., & Ribeiro, R. M. (2021). Prevalence of SARS-CoV-2 Antibodies after First 6 Months of COVID-19 Pandemic, Portugal. Emerging Infectious Diseases, 27(11), 2878–2881. https://doi.org/10.3201/eid2711.210636

 

  • Santos, C. D., Santos, A. F., das Neves, R. C., Ribeiro, R. M., Rodrigues, F., Caneiras, C., Spruit, M. A., & Bárbara, C. (2021). Telemonitoring of daily activities compared to the six-minute walk test further completes the puzzle of oximetry-guided interventions. Scientific Reports, 11(1), 16600. https://doi.org/10.1038/s41598-021-96060-w

 

  • Kamel Boulos M.N., Kwan, M.P., El Emam, K., Chung, A.L., Gao S., Richardson, D.B. (2022). Reconciling public health common good and individual privacy: new methods and issues in geoprivacy. International Journal Health Geographics. 21(1):1. https://doi.org/10.1186/s12942022003009

 

  • Koh, K., Hyder, A, Karale,Y., Boulos, M.N.K. (2022). Big Geospatial Data or Geospatial Big Data? A Systematic Narrative Review on the Use of Spatial Data Infrastructures for Big Geospatial Sensing Data in Public Health", Remote Sensing, 14 (13): 2996. https://doi.org/10.3390/rs14132996

 

  • Canto E Castro, L., Gomes, A., Serrano, M., Pereira, A., Ribeiro, R., Napoleão, P., Domingues, I., Silva, C., Fanczal, J., Afonso, Â., Lopes, A., Toader, I., de Sousa, M., de Sousa, J., de Sousa, G., Mota, M. M., Silva-Santos, B., Veldhoen, M., & Ribeiro, R. M. (2022). Longitudinal SARS-CoV-2 seroprevalence in Portugal and antibody maintenance 12 months after infection. European Journal of Immunology, 52(1), 149–160. https://doi.org/10.1002/eji.202149619

 

  • Malato, J., Ribeiro, R.M., Pinto Leite, P., Casaca, P., Fernandes, E., Antunes, C., Fonseca, V.R., Carmo Gomes, M., Graça, L. (2022). Risk of BA.5 infection in individuals exposed to prior SARS-CoV-2 variants, New England Journal of Medicine. 387:953-954. https://doi.org/10.1056/NEJMc2209479

Recursos

De momento não temos oportunidades em aberto.

 Gender Mainstreaming in Medical research

 

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Contactos

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Gestora de Projeto
Brígida Riso
 

Última atualização: janeiro de 2023


  

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This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 Research and Innovation programme under grant agreement No 952377
Telefone
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