A Imunologia Clínica é uma área transversal à maioria das especialidades médicas e cirúrgicas, sendo atualmente consensual que muitas das intervenções terapêuticas moduladoras da história natural de múltiplas doenças terão provavelmente que ter uma base imunológica.

No âmbito do ciclo clínico da FMUL, a existência desta unidade orgânica – Laboratório de Imunologia Clínica – tem uma relevância estratégica fundamental. Por um lado assegura um ensino e investigação alicerçados numa base laboratorial reconhecidamente indispensável à especialidade de Imunoalergologia e Imunologia Clínica. Por outro lado, garante a estreita interação de um laboratório de diagnóstico diferenciado e investigação com as diversas clínicas universitárias ligadas à assistência médica nas doenças de base imunológica, integrando o Centro de Imunodeficiências Primárias do CAML.

O Laboratório de Imunologia Clínica desenvolveu-se na interface da FMUL com o Hospital de Santa Maria em associação com o laboratório do Instituto de Medicina Molecular (IMM), liderado pela Prof.ª Dr.ª Ana Espada de Sousa. O Laboratório de Imunologia Clínica integra assim plenamente o espírito do Centro Académico de Medicina de Lisboa (CAML) pretendendo ter um papel catalizador das três instituições envolvidas, contribuindo para uma melhor formação pré e pós graduada, melhores cuidados de saúde e para o desenvolvimento de investigação de qualidade internacionalmente competitiva.

O trabalho de investigação que tem vindo a desenvolver é internacionalmente reconhecido nas seguintes áreas de imunologia humana:
- Infecção HIV/SIDA com destaque para infecção pelo HIV-2;
- Reconstituição imunológica focado no desenvolvimento de células T no timo humano e na homeostasia das células T CD4 naives;
- Regulação das respostas imunitárias e células T reguladoras Foxp3+;
- Imunodeficiências primárias;
- Imunoterapia especifica na doença alérgica;
- Imunologia das mucosas.