iMM Corner
Inteligência artificial como ferramenta para encontrar melhores fármacos
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No trabalho agora publicado na revista científica Nature Chemistry*, os investigadores do iMM Tiago Rodrigues e Gonçalo Bernardes, em conjunto com o investigador Daniel Reker do MIT, discutem o impacto que agregados de pequenas moléculas têm na descoberta de fármacos, tanto a nível académico, mas mais importantemente a nível da indústria. Este estudo apresenta, pela primeira vez, uma análise em larga escala para investigar a real frequência deste fenómeno.
São vários os requisitos chave para assegurar a utilidade de uma nova entidade química, destacando-se o reconhecimento molecular específico, a ligação reversível e a dependência da dose. No entanto, os ensaios usados para encontrar e despistar novos fármacos podem gerar falsos positivos como os agregados coloidais. “Estimamos que 5-20% de todas as moléculas testadas até à data contra alvos de interesse têm a capacidade de formar agregados. Isto significa que cerca de 20 mil resultados de atividade reportados na literatura poderão estar potencialmente comprometidos”, explica Tiago Rodrigues, investigador do iMM.
“Infelizmente a comunidade científica não está suficientemente alerta para o facto destes agregados inibirem proteínas, enzimas e afins por um mecanismo de sequestração (ou seja, de forma patológica) e não de forma específica como seria desejado e a inibição por estes mecanismos inespecíficos é apenas um artefacto que muitas vezes passa despercebido”, refere ainda Tiago Rodrigues.
Neste trabalho, os investigadores implementaram modelos de inteligência artificial, previamente reportados, e discutiram de que forma estes modelos podem ser utilizados para fazer a triagem de moléculas com potencial agregador daquelas que poderão ser desenvolvidas com o objetivo de originar fármacos eficazes.
*Daniel Reker, Gonçalo J. L. Bernardes & Tiago Rodrigues (2019) Computational advances in combating colloidal aggregation in drug discovery. Nature Chemistry, 11(402–418).
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Inês Domingues
Diretora de Comunicação do iMM João Lobo Antunes
No trabalho agora publicado na revista científica Nature Chemistry*, os investigadores do iMM Tiago Rodrigues e Gonçalo Bernardes, em conjunto com o investigador Daniel Reker do MIT, discutem o impacto que agregados de pequenas moléculas têm na descoberta de fármacos, tanto a nível académico, mas mais importantemente a nível da indústria. Este estudo apresenta, pela primeira vez, uma análise em larga escala para investigar a real frequência deste fenómeno.
São vários os requisitos chave para assegurar a utilidade de uma nova entidade química, destacando-se o reconhecimento molecular específico, a ligação reversível e a dependência da dose. No entanto, os ensaios usados para encontrar e despistar novos fármacos podem gerar falsos positivos como os agregados coloidais. “Estimamos que 5-20% de todas as moléculas testadas até à data contra alvos de interesse têm a capacidade de formar agregados. Isto significa que cerca de 20 mil resultados de atividade reportados na literatura poderão estar potencialmente comprometidos”, explica Tiago Rodrigues, investigador do iMM.
“Infelizmente a comunidade científica não está suficientemente alerta para o facto destes agregados inibirem proteínas, enzimas e afins por um mecanismo de sequestração (ou seja, de forma patológica) e não de forma específica como seria desejado e a inibição por estes mecanismos inespecíficos é apenas um artefacto que muitas vezes passa despercebido”, refere ainda Tiago Rodrigues.
Neste trabalho, os investigadores implementaram modelos de inteligência artificial, previamente reportados, e discutiram de que forma estes modelos podem ser utilizados para fazer a triagem de moléculas com potencial agregador daquelas que poderão ser desenvolvidas com o objetivo de originar fármacos eficazes.
*Daniel Reker, Gonçalo J. L. Bernardes & Tiago Rodrigues (2019) Computational advances in combating colloidal aggregation in drug discovery. Nature Chemistry, 11(402–418).
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Inês Domingues
Diretora de Comunicação do iMM João Lobo Antunes