De acordo com o estipulado na Portaria que criou o Centro Académico de Medicina de Lisboa, o Conselho Diretivo do CAML (CD-CAML) é composto pelos dirigentes das três instituições que o integram: pela FMUL, o Diretor, Professor Doutor Fausto J. Pinto; pelo CHULN, o Presidente do Conselho de Administração, Dr. Carlos Neves Martins, e pelo iMM, a Presidente, Professora Doutora Maria do Carmo Fonseca.
Na sequência do entendimento acordado relativo à rotatividade da Presidência deste órgão entre as três Instituições, foi aprovado por unanimidade, na reunião do CAML de 10 de dezembro de 2018, que a Presidência do CD-CAML no triénio 2019-2021 será assegurada pelo Diretor da FMUL, Prof. Doutor Fausto J. Pinto.